Exogenous microRNA

Ref.: Lin Zhang, et al, Exogenous plant MIR168a specifically targets mammalian LDLRAP1: evidence of cross-kingdom regulation by microRNA, Cell Research, 20 September 2011

這篇大陸的研究，剛好和我與學長在西雅圖某單位研習的那段時間有點關係。那個時候學長的上司發現了可能有 Exogenous microRNA。所以做了 NGS 實驗，要我幫忙分析，而且學長和工研院合作時，也發現了類似的現象。如果說外界的 microRNA，可以透過某些途徑，像是食物攝取，來影響人的基因調控，這就變得很有趣了。

很可惜的是，一方面團隊中某些人似乎並沒有太把這個方向放在心上，另一方面他們的實驗設計有問題，所以進度一直在原地打轉。

就這樣拖著拖著，別人就把這個發現發表出來了。我看到這篇論文當天就轉寄給大家看，後來學長的上司還寫了一封信給相關研究者，表示非常遺憾之類的。

我和學長的立場是認為這不太可能是真的，畢竟 microRNA 這麼短，在加上 NGS data 準確度還很有問題，根本很難判定這是不是雜訊。所以那個時候大家的想法是認為這也有可能是樣本污染之類的，這也花了我們不少時間去分析資料。可是詭異的是，在實驗設計方面，他們一直用一些拐彎抹角的方法去驗證，我和學長有討論建議一些簡單的實驗設計可以直接看出結果，他們雖然認為可行，卻不願意採用。

這也是讓我在跨領域合作失望的經驗，當他們對資訊人做的東西有意見時，常常指手畫腳；但是反過來我們的意見卻常常被忽視，好像要他們做個 PCR 之類的分子生物學基本實驗也是不合理的要求一樣。

我和學長的研究雖然不直接和這個題目相關，但是我想如果這個題目進展順利的話，我們現在的想法應該不至於會那麼排斥和生物學家合作吧。(雖然說不是所有的生物學家都這樣，但是目前為止，我還真沒有讓我覺得愉快的合作經驗。)

人需要出走嗎?

最近友人在 facebook 上貼了蔣勳的一篇文章 人需要出走. (找不到原文出處, 是否偽托蔣勳作品都不確定, 但我把原文附於文後.)

某位部落客友人很認同地寫下這段話

所謂出走就是遠離習慣的環境去看看其他生活的可能，侷限在台灣的旅行還是在同一個框架內。邏輯上的認知跟實際走過一遭的認知是截然不同的兩回事，好比我早知道印度很窮，但實際走訪才「較為理解」所謂的貧窮是怎麼回事，那是台灣的人難以體會的。

出去玩就出去玩, 沒啥不好, 能感受到什麼都是自己的收穫, 能收穫到什麼是看個人心性和造化. 旅遊只是提供改變的可能性的一種方法, 不高於別的, 也不低於別的.

要了解台灣哪裡窮, 也不是在台灣旅行就可以的, 旅行的功能也不僅止於此而已. 拿來相比真的沒啥意義。而且旅行者常常想要看一些有地方特色的東西，反而忽略了一些大眾特色的東西，但是這種大眾特色的東西，像是連鎖餐廳，不是更能表現出那個國家的現狀？門牌地址編碼原則也是一個很好的例子，這些東西是常見但反而不會被重視。然而這些冰冷冷的制度面，是不是更系統地呈現了當地國族文化特色？

[轉載] 蔣勳：人需要出走

其實我不太講旅行或旅遊，我常常用的一個字是「出走」。人在一個環境太久了、太熟悉了，就失去他的敏銳度，也失去了創作力的激發，所以需要出走。

我在七O年代在歐洲讀書，那時候我寫關於文藝復興的藝術史，老師問我，「你有沒有去過義大利？」我說還沒有。他說，「你沒有在米開朗基羅的雕像前，熱淚盈眶，你怎麼敢寫他？」後來我在義大利跑了一個月。身上就是一個背包，兩件襯衫。我也曾經睡火車站，那時候坎城的火車站是一片年輕人睡在裡面。他們問我，「你怎麼沒帶報紙？要鋪報紙的。」他們就分給我。早上五點，警察帶了一大桶的咖啡，噹，噹，噹，敲著桶子，叫醒大家，請大家喝完咖啡離開，火車站要營運了。

不要問該準備什麼？先問你愛什麼？

歐洲有種青年出走的文化。我在翡冷翠（編按：義大利佛羅倫斯）認識十四歲的蘇格蘭小孩，帶個氈呢帽，打掃廁所一個學期存的錢，就到歐洲來旅行。花完了，一點也不害怕，就去街上吹蘇格蘭風笛，再繼續下一段的旅行。我那時候感觸很深，不同的文化，年輕人可以這麼不一樣。他們將來長大以後，擔當的事情也絕對不一樣。我們宋朝詩人柳永說，「今宵酒醒何處？」中國文化裡面本來有這個東西。可是這個文化老了，失去了走出去的勇敢。年輕人的生命力沒有了，生命力消失了。

我希望壯遊，帶動的是年輕人走出去，打出一片天。如果今天不能打出一片天，將來一輩子也不會有出息。很多人要去歐洲，都會覺得我在歐洲很久，就會來問我：「我要去歐洲，要準備什麼？」我就會反問他，「你覺得你要去做什麼？」當你自己很清楚要做什麼、意志力很強的時候，所有困難可以一層層克服。我們今天小孩的準備，他們的信用卡、語文，絕對比當年拿著商品樣本在歐洲闖的台灣商人好，但是他們就是走不出去，因為他們的安全感。甚至有人好幾年都在問，但最後就是走不出去。

其實壯遊有一部分，是先走出去再說。

我常常跟朋友說，《西遊記》孫悟空那麼厲害，他一翻筋斗就是十萬八千里，那他去取經不是很容易嗎？為什麼是唐三藏取經？因為孫悟空沒有動機，而唐三藏有動機，雖然沒有取經的能力。但是動機是比能力重要的。沒有動機，根本就沒有出發點，連起跑點都沒有。只要有動機，都很棒。最怕的是無所愛。如果年輕人想要走出去，我會問他，「你愛什麼？」如果喜歡搖滾，要去玩重金屬，想要跟樂團，我都覺得很好。此外，「壯遊」的「壯」字，不只是炫耀。壯這個字，包含了一個深刻的，跟當地文化沒有偏見的對話關係。

旅遊是很大的反省，是用異文化，去檢查自身文化很多應該反省的東西。比較裡面，才瞭解文化的不同，沒有優劣。就像寫《裨海紀遊》（編按：清朝康熙年間記錄台灣山川風物之著作）的郁永河，他看到原住民被抓來拖牛車，下雨他們就在淋雨。他就問：「為什麼不讓他們在屋簷下躲雨？」翻譯官就告訴他，「他們其實跟動物差不多，他們是不怕淋雨的。」郁永河就嘆了一口氣說，「亦人也。」所有好的旅遊書，都會有這個觀點。著有《真臘風土記》、出使吳哥城的周達觀是元朝的北方人，所以他南下的時候，受不了天氣。他不瞭解當地人怎麼每天洗好多次澡。一年之後，他變了。當初他帶著大國心態，當時元朝那麼偉大，但他後來說，真臘（編按：今日的柬埔寨吳哥窟），一個小小的東南亞國家，可是禮儀這麼嚴整，「不可輕視也。」我覺得，人不可能沒有主觀，可是慢慢在旅遊裡面，修正自己的偏見跟主觀，才是好的旅遊。

不只向外觀察，而是向內反省。

即使只是參加旅行團，也可以有不一樣的體驗跟視野。現在資訊真的很發達，在出發以前，做一些準備的工作。第二個，到現場之後，盡量檢討自己的主觀。我帶朋友去吳哥窟，我會說，「我現在帶你們去柬埔寨人的家。」他們下車都會嚇一跳，真的什麼都沒有。我們叫做「家徒四壁」，他們連壁都沒有。我在台灣，老覺得我還缺什麼。到那裡，我第一次想：「我在台北家有什麼。」我以為我比他們富有。可是後來我看到他們男男女女從田裡回來，脫光光的在河裡、蓮花當中，彼此潑水、唱歌，我覺得他們比我富裕太多了。我一生當中都沒有這樣的經驗。我覺得這就是個很大的收穫。所以我覺得任何一個旅遊都值得，因為只要一對比，你都會回來檢討自己的生命意義和價值。旅遊不只是看，更是找到自己內在，最美的東西。外在的風景，其實是你自己的心情。所以壯遊絕對不只是向外的觀察，而是向內的反省。

門牌地址編碼原則

Derek Sivers 在 TED 上給了一個很有趣的演講 -- 古怪還是不同?。Derek Sivers 在演講裡介紹了美國日本的門牌地址編碼原則的不同。現在有提供中文字幕，有興趣的人可以看一下。

梅と桜 這個網站也寫了一系列的文章介紹這件事，例如 :日本的門牌地址編碼原則, 日本的道路 (6)。

台灣人在向他人說明一個地方的位置時，通常用「○○路△△巷□□號」就可以解決大部分的問題了，少數解決不了的問題通常是道路不連貫 (例如台北的新生南路和新生北路)，或是道路上有太奇怪的分枝。由於日本的道路管理系統和台灣不同，日本人不可能像台灣人一樣理所當然地說出：「○○路△△巷□□號」。日本人在向他人說明地址時是相當辛苦的一件事。

美國的道路編碼跟台灣蠻像的，基本上越新的城市規劃得越好，基本上是以棋盤狀規劃，路很好找，但是如果到市中心這種發展已久又變動得快的地方，其實也是歪七扭八。

Ref.: 奧斯汀資訊 - 美國的街道名稱與門牌號碼

習慣上每一千號近似一英哩的長度，若是某路段沒有房子號碼仍保留，某些社區住宅緊緊相鄰但不一定就只差兩號，可能相差 4, 6, 8, 10, 不等，視各戶面街的寬度而定。所以有時看到某地址門牌號碼，就可以概略估計距離，例如同一條路12350 就與18350 相距約六英哩。每一條街道門牌號碼不必從一號開始排，每個城鎮也不必自訂門牌號碼的坐標原點，而是參照整個地區的東西與南北坐標，可能由幾萬號開始排，但是通常最多用到五位數字。 AAA的市區地圖，常常在某些主要道路旁，用紅色細字印上整百或整千的區段號碼，以供參照方便找尋地址位置。

理想狀況是在某個區塊內，門牌應該是照順序排列。例如 甲路上的某一區塊，應該是 1000 到 1500 號，但是實際上沿著路走過去，可能會看到 1010, 1022, 1100, 1034 這種奇怪的順序。而且門牌和門牌之間也可能會跳號，我想主要是因為改建規劃的原因。

而且美國的道路也常常會被 區塊截斷，例如中間被一個公園隔開，當然在看地圖時沒啥困擾，但是真的置身在街道上找路時，倒也不是那麼好找。這點台灣也是一樣。

有一個叫 Dan Jacobson 的人寫了相關的介紹，他的中文有點難懂，不過可以看看英文版。還蠻有趣的。

美國、加拿大（除兩者老東部）門牌號碼做得有條無紊。 能不能應用到台灣？ 只是我無心連跟拔起人家現有的門牌。 等有新市鎮規劃， 或趁一次的沒完沒了的門牌「整編」， 看能不能重編得可用長久。

我同意 Dan Jacobson 說的，台灣的道路規劃實在不太好，但是話說回來台灣地窄人綢，很多中小型市鎮，像是中壢市，土地面積大約等於 Bellevue (西雅圖附近的城市)，它的人口密度為 4,857/km²，而 Bellevue 的人口密度僅為 1,524/km²。某個程度上大概跟美國老東部碰到的狀況很像。這是在是很無奈的狀況。

牛排/牛肉小記

這一篇應該可以算是鏈結整理. 主要跟牛排有關.

我原本是要貼 Evil Capitalism Heroes 的 關於牛排 (1) / 關於牛排 (2) 了事, 不過他好像把就文章刪掉了. 我個人對所謂的 乾式熟成牛肉（Dry-aged beef） 蠻有興趣的. 比較高級的牛排我只吃過 茹絲葵 (Ruth's Chris), 很可惜他們並不是採用乾式熟成.

Ref.: 誰可以分享煎牛排的作法？ - Mobile01 景點討論
Ref.: 牛肉的熟成解說(Beef Aging) - 木公部落格 - Yahoo!奇摩部落格
Ref.: YouTube - Peppercorn Steak (Steak Au Poivre)

另外是一些關於美國牛肉能不能吃的文章.

Ref.: 美國牛肉爭議的一些科普ABC與雜談
Ref.:The Sky of Gene: 〈群魔亂舞的美國牛肉〉的科學依據
Ref.:The Sky of Gene: 群魔亂舞的美國牛肉

原本是要寫一些東西, 但是一直沒有時間整理, 所以就直接貼出來了.

Albert Einstein and James Watson

Ref.: 華生訪台效應 | 羅時成的部落格

另外他綜合個人成功關鍵的幾大原則與聽眾分享： 第一，挑選研究題目要超越當時所作的領域 ( 如當時DNA結構尚未解開 ) ； 第二，研究題目要定在幾年內可預期成功 ( 當時大家預期DNA結構在兩、三年內將被解開) ； 第三，和你智能相當的人成為研究伙伴 ( 如果沒有和克立克結為伙伴，他個人可能無法解開DNA結構 ) ； 第四，與你在相同領域的競爭對手維持連繫 ( 如他和威爾金斯、佛蘭克林的接觸　) ； 第五，不要成為一間房間裡最耀眼的人 ( 鮑林犯錯別人都不敢指正他 ) ； 第六，要結交一些永遠會伸出援手幫助你的人 ( 如貝魯茲和肯卓爾對他的幫忙 ) 。

之前我提過, 我上司認為華生可以和愛因斯坦齊名, 我個人是完全不認同. 連華生自己都說當年大家預期DNA結構在兩、三年內將被解開. 也就是說，就算他沒發現雙螺旋結構，似乎也不會拖太久，數年內可能也會有人發現。

認為 Charles Robert Darwin 和 Albert Einstein 齊名我倒是覺得合理.

奴才還是人才

Ref.: 中央研究院發布《人才宣言》呼籲重視人才供需失衡問題 完整版

此外，政府對「勞工」及「公務人員」的定義僵化，衍生許多不利於科研發展的因素。譬如研究助理及博士後研究人員照理應還在被訓練及學習階段，但被視為「勞工」，使原來的師生關係變成僱傭關係，這類不合理的規定，亦應適度放寬。

外國人需取得國內外大學相關系所之碩士以上學位，或取得相關系所之學士學位而有二年以上相關工作經驗，方得受聘僱從事專門性及技術性工作；此外，僑生與外籍生畢業後，在臺工作的起薪需達最低下限新台幣4 萬7 千9 百餘元，這類規定也使得我們失去彈性，無法適時延攬所需人才為臺灣所用，且是將辛苦培養的人才拱手讓人，造成國家投資的浪費。

Ref.: 科技大老：人才問題最迫切-Yahoo!奇摩新聞

宣明智更直言，人力市場產業供需嚴重失調，但大家卻不太敢談外勞跟本勞脫勾問題，如果外勞是照新加坡等國家依市場價格取得，將有很大節省空間，
有足夠的外勞，相信台商就會回流。

看到這樣的報導，的確會讓人很想問這些人要找的是奴才還是人才？ 我們希望留下自己所培育的高階人才，但是卻期望薪資低於新台幣4 萬7 千9 百餘元？

我個人比較偏向右派思想，並不是太重視生活品質那一派，我尊重競爭，也認為要有競爭才會變好。但是看到這樣的文章我還是很困惑。這真的能夠吸引人才嗎？如果台灣真的沒有人才，我們可以向國外招募，自己培育，或者送到國外培育。但是為啥會是壓低薪資，這我就真的不懂。

Ref.: The 24/7 lab: in praise of time out | Code for Life

所羅門72柱魔神，查看你的守護惡魔

Ref.:【空想庫藏】惡魔討論十二 --- 所羅門72柱魔神，查看你的守護惡魔《白晝篇》
Ref.:【空想庫藏】惡魔討論十三 --- 所羅門72柱魔神，查看你的守護惡魔《黑夜篇》 - xxzzyy的創作 - 巴哈姆特

還蠻有趣的，有興趣的人可以去找看看自己的守護惡魔啥.....

Ref.: Stolas - Monstropedia

Stolas is a great prince, appearing in the forme of a nightraven, before the exorcist, he taketh the image and shape of a man, and teacheth astronomie, absolutelie understanding the vertues of herbes and pretious stones; there are under him twentie six legions. Pseudomonarchia daemonum - Johann Wier (1583)

The Thirty-sixth Spirit is Stolas, or Stolos. He is a Great and Powerful Prince, appearing in the Shape of a Mighty Raven at first before the Exorcist; but after he taketh the image of a Man. He teacheth the Art of Astronomy, and the Virtues of Herbs and Precious Stones. He governeth 26 Legions of Spirits; and his Seal is this, which is, etc. Goetia - S. L. MacGregor Mathers (1904)