來到生醫研究機構來學習一年多, 看了一些現象, 也學了很多東西. 當然也有很多不適應的地方, 尤其是研究方式和文化.
當學術界是某些領域的高等教育的唯一出路，再加上這十幾年來的高教膨脹，學術研究這兩字的招牌自然要退色。很多人在怪罪的 impact factor 量化研究成果造成歪風，但是真正的原因難道不是因為高教膨脹？競爭激烈，領域分劃細微，研究期刊爆增，人力根本很難去評估好壞了；再加上競爭者越多越容易在意公不公平的問題。以成為大師為職志的學者可能不在乎這種微支末節，但是一般的學術公務員可在乎得緊。 impact factor 只是應運而生而已。
在四五年前，我考慮是否要念博班時，曾經很苦惱思索。
除了出路好壞這些問題，我也很在意自己會怎麼做研究 -- 安逸地在大學裡教書，做些可有可無的研究。這不是我心中對學術的景象。
但是我後來還是選擇唸了博士班。
基於很多理由，包括資質限制，我不敢期望自己在理論領域有好的表現，我所期待的研究形式，是更接近應用科學的。所以我希望走比較應用的那種領域。我當年決定念博班時給自己的期望，是希望能到業界上班，希望不要喪失拼鬥精神，希望能找到那種能夠讓我的訓練有用武之地的應用領域。所以我左思右想，寫了一份自認有機會應用到業界的理論 proposal 去申請博士班。
就算無法成為 Maxwell，無法成為 Hertz，是不是有機會成為 Heaviside？ (其實 O. Heaviside 也是大師級人物!我這樣寫其實是很不要臉的)
Ref.:【科技歷史】瞧 ! 馬克斯威爾來了 « CASE PRESS
總而言之，拿〈論物理力線〉作為物理科學絕對純粹性的一項例證，並不恰當。馬克斯威爾的方程式直到發表後二十五年，才被表達成今日最熟悉的形式。最有名的那四條電磁力和電磁通量方程式，它們簡潔又經濟的表達式，得歸功於卓越的倫敦電信技師希維賽德（Oliver Heaviside）。他一八八五年將這些表達式發表在讀者為電子工程師和商人的商業期刊《電子技師》(Electrician)之上。
身為一八六○年代海底電纜計畫的老兵，希維賽德亟需數學工具來控制能量傳遞，以避免訊號扭曲或遺失。這位孤獨的電信技師並不知道，一位年輕的德國物理學家赫茲（Heinrich Hertz），在同時也建立了這套簡化的場方程表達式。即使是涉及這些表達式最令人熟悉，也明顯是最抽象、最數學形式的部份，現實的問題依然幫助完成了這些漂亮的數學式子。在一八八五年之後的一段時間，它們被稱作赫茲—希維賽德方程式，而非馬克斯威爾方程式。
但是很多因緣巧合.......，後來改做生物資訊。我會覺得，資料分析是一門很重要的學問，所以也打算好好學習。簡簡單單跑一些數據出來是很容易，但是要做到能夠乾淨清楚，就非常困難了。經濟分析就是一個很好的例子。
但是我不想花太多精神做服務生物學家的工具，在電腦時代，每一個上班族都會用 WORD 和 EXCEL，因為這是工作需要，為什麼生物學家可以例外？如果需要去用那些複雜的軟體，他們就該去學，如果要用好用的軟體，他們就該聘專人來優化，而不是浪費另一個領域的學術資源來為他們服務。
服務性的網站不是不能做，像 miRBase 和 Pfam 都很重要，問題是，誰來 Host 這個東西！？我個人認為，生物學家應該學習其他領域，很多物理學家要跑數值分析，他們可以去學 matlab, mathematica, 或者 fortran, 生物學家又不比人笨，為啥就不能去學? NCBI SRA 都必須要結束，UCSC Genome browser 似乎也沒有過去那種活力了。這些 user friendly 最後總會撐不住的。這些人應該要跟計算生物學家和生物統計學家合作，並且也該學習如何使用這些軟體。 我想不只我一個人這麼認為 (A,B)
如果將來有機會管一個部門，用生物學家的錢，像是 Broad 或者 DNASTAR 這樣，開發容易使用的軟體倒是沒啥不好。但是耗用生物資訊學門/生物科技學門/計算生物學門的經費來做這種 UI 改善的工具，我到是不以為然。相同的觀點，也可應用到其他領域，我們應該讓下一代的年輕工程師將心力浪費在這些東西上面嗎?(如果是在 facebook，有物質上的回報也就算了。)
This Tech Bubble Is Different - BusinessWeek
After a couple years at Facebook, Hammerbacher grew restless. He figured that much of the groundbreaking computer science had been done. Something else gnawed at him. Hammerbacher looked around Silicon Valley at companies like his own, Google (GOOG), and Twitter, and saw his peers wasting their talents. "The best minds of my generation are thinking about how to make people click ads," he says. "That sucks."網路上可以找到中文翻譯，如下：
但是在Facebook呆了幾年以後，Hammerbacher開始感覺不自在了。他覺得許多重大的計算機科學創新和突破很早之前就已經完成了。他也仔細的思考了一下周圍的這些公司包括Facebook，Google和Twitter等，看著自己和同學在為這些公司賣命，他不禁開始覺得：「我們這一代最聰明的人竟然都在這裡思考著怎樣讓人們去大量的點擊廣告，真衰。」
這樣的態度是太過理想性嗎？
或許吧。但是就像我女朋友鼓勵我的 --- 『人沒有理想要怎麼活?』
我出生於商人家庭，我祖父白手起家，到了我爸那代，他沒分到什麼資源，也是白手起家。我在他們身上學到的，就是要往上爬要靠自己。我祖父我老爸雖然不是什麼有道德的人，但是他是那種有錢不一定願意賺的人，尤其是那種上位者用權勢變出來的 case，他是不接的。他們寧願在商場上硬碰硬，或者用勞力賺錢。這是我佩服的。
附帶一提，我女友跟我說 --- 她和我一起撿垃圾總是活得下來。
雖然誇張了一點，但是讓我很感動倒是真的。
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